Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt82Q99M74 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt82Q99M74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt82Q99M74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt82Q99M74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt82Q99M74 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms