Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smtnl1Q99LM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smtnl1Q99LM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smtnl1Q99LM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms