Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RtcbQ99LF4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RtcbQ99LF4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RtcbQ99LF4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RtcbQ99LF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RtcbQ99LF4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RtcbQ99LF4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms