Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR8

Fuca2, Plasma alpha-L-fucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fuca2Q99KR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fuca2Q99KR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fuca2Q99KR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fuca2Q99KR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fuca2Q99KR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fuca2Q99KR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.7 ms