Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpifQ99KR7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpifQ99KR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpifQ99KR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms