Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdxdc1Q99K01 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdxdc1Q99K01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdxdc1Q99K01 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdxdc1Q99K01 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdxdc1Q99K01 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms