Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxp3Q99JB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxp3Q99JB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxp3Q99JB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms