Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd1Q99J36 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Thumpd1Q99J36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thumpd1Q99J36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thumpd1Q99J36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms