Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CITED2Q99967 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CITED2Q99967 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CITED2Q99967 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms