Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP2Q99959 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP2Q99959 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP2Q99959 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms