Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMP4Q99727 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP4Q99727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms