Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTRQ99707 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRQ99707 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRQ99707 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRQ99707 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTRQ99707 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTRQ99707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTRQ99707 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTRQ99707 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTRQ99707 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTRQ99707 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRQ99707 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRQ99707 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRQ99707 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRQ99707 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTRQ99707 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRQ99707 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRQ99707 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRQ99707 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRQ99707 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTRQ99707 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTRQ99707 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTRQ99707 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTRQ99707 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTRQ99707 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTRQ99707 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTRQ99707 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTRQ99707 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRQ99707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRQ99707 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRQ99707 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTRQ99707 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTRQ99707 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTRQ99707 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTRQ99707 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTRQ99707 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTRQ99707 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTRQ99707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTRQ99707 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTRQ99707 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTRQ99707 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTRQ99707 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRQ99707 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRQ99707 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRQ99707 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRQ99707 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTRQ99707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTRQ99707 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTRQ99707 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTRQ99707 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRQ99707 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRQ99707 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRQ99707 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRQ99707 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTRQ99707 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRQ99707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRQ99707 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTRQ99707 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTRQ99707 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTRQ99707 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MTRQ99707 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRQ99707 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRQ99707 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRQ99707 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTRQ99707 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms