Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNN2Q99439 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN2Q99439 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN2Q99439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms