Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS4Q96RK4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BBS4Q96RK4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS4Q96RK4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS4Q96RK4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms