Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARXQ96QS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARXQ96QS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ARXQ96QS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARXQ96QS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms