Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF558Q96NG5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF558Q96NG5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF558Q96NG5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms