Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE2Q96MF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE2Q96MF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE2Q96MF7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms