Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
STAC3Q96MF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
STAC3Q96MF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
STAC3Q96MF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
STAC3Q96MF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAC3Q96MF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STAC3Q96MF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
STAC3Q96MF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
STAC3Q96MF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
STAC3Q96MF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms