Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPZA3Q96KX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPZA3Q96KX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPZA3Q96KX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms