Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00208Q96KT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00208Q96KT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms