Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNDP1Q96KN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNDP1Q96KN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNDP1Q96KN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNDP1Q96KN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms