Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDLIM2Q96JY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM2Q96JY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM2Q96JY6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms