Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC136Q96JN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC136Q96JN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC136Q96JN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC136Q96JN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms