Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHAMP1Q96JM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAMP1Q96JM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAMP1Q96JM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms