Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EAF1Q96JC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EAF1Q96JC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EAF1Q96JC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EAF1Q96JC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms