Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH6

TMEM19, Transmembrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM19Q96HH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM19Q96HH6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM19Q96HH6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM19Q96HH6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM19Q96HH6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM19Q96HH6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms