Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP6Q96FZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP6Q96FZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP6Q96FZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP6Q96FZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms