Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM12Q96EX1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM12Q96EX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM12Q96EX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms