Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIRT1Q96EB6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SIRT1Q96EB6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SIRT1Q96EB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SIRT1Q96EB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms