Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXorf40BQ96DE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CXorf40BQ96DE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf40BQ96DE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms