Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHISA4Q96DD7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHISA4Q96DD7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHISA4Q96DD7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHISA4Q96DD7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHISA4Q96DD7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms