Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NMD3Q96D46 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NMD3Q96D46 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms