Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC58Q96CX6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC58Q96CX6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC58Q96CX6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC58Q96CX6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms