Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP3Q96CW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP3Q96CW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP3Q96CW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP3Q96CW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms