Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf43Q96C57 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf43Q96C57 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf43Q96C57 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms