Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAMM41Q96BW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAMM41Q96BW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAMM41Q96BW9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAMM41Q96BW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms