Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APH1AQ96BI3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APH1AQ96BI3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1AQ96BI3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1AQ96BI3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms