Protein–RNA interactions for Protein: Q96AP4

ZUFSP, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZUFSPQ96AP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZUFSPQ96AP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZUFSPQ96AP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZUFSPQ96AP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZUFSPQ96AP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZUFSPQ96AP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms