Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARVELD3Q96A59 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARVELD3Q96A59 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARVELD3Q96A59 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARVELD3Q96A59 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms