Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKD2Q969F2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKD2Q969F2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKD2Q969F2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NKD2Q969F2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms