Protein–RNA interactions for Protein: Q92797

SYMPK, Symplekin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYMPKQ92797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYMPKQ92797 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYMPKQ92797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYMPKQ92797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms