Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC2Q92769 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC2Q92769 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC2Q92769 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms