Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSC1Q92574 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms