Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S1Q92572 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S1Q92572 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S1Q92572 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms