Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1l1Q923U0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1l1Q923U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1l1Q923U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tom1l1Q923U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms