Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sirt1Q923E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sirt1Q923E4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sirt1Q923E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sirt1Q923E4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sirt1Q923E4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sirt1Q923E4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sirt1Q923E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sirt1Q923E4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sirt1Q923E4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sirt1Q923E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sirt1Q923E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms