Protein–RNA interactions for Protein: Q923B1

Dbr1, Lariat debranching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbr1Q923B1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dbr1Q923B1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dbr1Q923B1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dbr1Q923B1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dbr1Q923B1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dbr1Q923B1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms