Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb6Q922F4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb6Q922F4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb6Q922F4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb6Q922F4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms