Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mthfd1Q922D8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mthfd1Q922D8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mthfd1Q922D8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mthfd1Q922D8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms