Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp1bQ91YK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp1bQ91YK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp1bQ91YK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms